Dėstydamas Vilniaus kunigų seminarijoje, organizavo ateitininkų kuopelę. 1945 m. įgaliojo ateitininkus J. Brazauską ir A. Dirsytę sukurti ateitininkų valdybą veikti pogrindyje.
 
1947 m. suimtas ir išvežtas į Vladimiro kalėjimą. ten 1953 m. , manoma, jog buvo nužudytas.
 
Užvesta beatifikacijos byla. Siekiama, kad bažnyčia M. Reinį paskelbtų šventuoju.

 
...Arkivyskupas M. Reinys išbūdavo visuose ateitininkų susirinkimuose iki galo. Kad daug dėmesio skiria ateitininkams, o nedirba ganytojiško darbo, kartais būdavo kritikuojamas kai kurių kunigų.